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Messi había realizado su debut no oficial para el primer equipo el 16 de noviembre de 2003 (a los 16 años y 145 días), en un partido amistoso contra el Porto, en aquel entonces entrenado por José Mourinho, en la inauguración del Estadio do Dragao.
Convirtiéndose en el tercer jugador más joven en jugar para el Barcelona -
Messi se estableció en el cuadro titular, marcando catorce veces en veintiséis partidos.100 El 12 de noviembre, en el partido contra Real Zaragoza, Messi sufrió una ruptura de metatarso que lo alejó por tres meses de las canchas
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Messi consiguió cinco goles en una misma semana colocando a Barcelona dentro de las cuatro primeras posiciones en La Liga. El 19 de septiembre anotó con el Barcelona en la victoria 3-0 sobre el Lyon en un encuentro de la Liga de Campeones
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Después de serle otorgada la camiseta «10», Messi fue elegido en el segundo lugar del Mejor Jugador del Mundo de la FIFA durante el 2008. Asimismo anotó su primer triplete de 2009 en la Copa del Rey contra el Atlético de Madrid en el cual el Barcelona ganó 3–1.122 El 1 de febrero de 2009
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Después de ganar la Supercopa de la UEFA en 2009, el entrenador de Barcelona Josep Guardiola aseguró que Messi era probablemente «el mejor jugador que jamás había visto»
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El 29 de agosto de 2011 en el primer partido de Liga de la temporada 2010/11 el Barcelona jugó ante el Racing de Santander en los Campos de Sport de El Sardinero, Messi anotó su gol 131 con la camiseta del Barça, colocándose como tercer máximo goleador de la historia del club en partidos oficiales
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El 25 de julio de 2011, Messi fue nominado junto a su compañero de equipo Xavi Hernández y al madridista Cristiano Ronaldo al premio de Mejor Jugador de la UEFA en Europa en la temporada 2010/11. Sorteo que tuvo su elección 25 de agosto en Mónaco,
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El 27 de octubre de 2012, Messi consiguió su gol oficial número 300 como profesional