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Se encontraba Hernán Cortes y sus hombres tratando de tomar Tenochtitlan mientras tenían apresado a Moctezuma en el antiguo palacio de Axáyacatl , Hernan salio unos dias y al regresar todo el pueblo Mexica salió a atacarlos por lo sucedido y al Moctezuma salir para tratar de calmar a su pueblo alguien lo golpeo en la cabeza y murió, y con eso España ganó.
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Alonso de Avalos recorrió el sur de Jalisco y tras someter a varios pueblos como Sayula, Zacoalco, Atoyac, Teocuitatlan, Amacueca y Techaluta, lo hizo casi sin violencia y respetando costumbres e instituciones indígenas. Las tierras se le otorgaron en encomienda y administrativamente pasaron a la Nueva España.
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Nuño Beltrán comenzó una expedición con trecientos españoles y seis mil indígenas, se aventuraron hacia el occidente del país enfretando y derrotando violentamente a todo el que se le atravesara, asi llegaron hasta el norte del país y al no encontrar riquezas se regresaron.
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Nuno Beltrán pertenecía, presidente de la primera Real Audiencia de la Nueva España y gobernador de Panuco, provincia de la costa del Golfo de México- a la que pretendía enlazar a otra provincia en el Océano Pacifico, totalmente independiente de la Nueva España-, y en abierta rivalidad con Hernán Cortes. Al frente de españoles, indios y artillería Nuno de Guzmán los lidero partiendo de la Ciudad de México para pasar por Tzintzuntzan.
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Durante la expedición de Nuno Beltrán este quiso fundar una población con el nombre de Espíritu Santo que seria la capital de un territorio llamado la Mayor España, pero el rey dio otras indicaciones y ordeno que se fundara una villa con el nombre de Santiago de Compostela, la cual seria capital del Reino de Nueva Galicia.
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Nuño Beltrán quiso fundar una villa con el nombre de su ciudad natal por lo que mando a dar nacimiento a Guadalajara en Nochistlán, para luego trasladarla a Tonalá.
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El juicio de residencia tarta sobre un tipo investigación a los funcionarios del gobierno, si al hacer la investigación encontraban que alguno incumpliera las leyes este era anunciado y pasado a juicio para así debatirlo correctamente, si el acusado perdía el juicio este podía ser desterrado o pagar una gran multa por sus acciones. Debido a que las expediciones de Nuño Beltrán de caracterizaron por extrema crueldad fue sometido a juicio y encarcelado por sus abusos y crímenes.
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Los indígenas molestos comenzaron a combatir contra los españoles ganándoles a varias tropas para que así los españoles hicieran de todo para tratar de vencerlos hasta que tiempo después en el Mixtón los españoles lograron vencerlos, todos estos enfrentamientos provocaron miles de muertes.