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Inestibilidad politica
Pelea entre los partidos Conservador, Liberal y Nacional.
Desorden económico.
Constitución del 1886
Intentos de Golpes de Estado en 1884 y 1885. -
El primer ataque se realizó en la ciudad de Bucaramanga, dando inicio a uno de los mayores enfrentamientos civiles que dejó más de 100 mil muertos en poco menos de 3 años. Aqui empezo la guerra que desencadeno la toma de poder de los Liberales en todo el departamento del Santander. Posteriormente, hubieron guerras liberales en el Cauca en cuidades como Tumaco y Palmira pero estas luego fueron vencidas.
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Los liberales siguieron tomando territorios, siendo siguiente el istmo. Aqui fueron poco tomandolo desde el oeste pero ya los Nacionalistas alcazaron a tomar Ciudad de Panamá; provocando una serie de enfrentamientos en que se dividian el istmo.
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Esta puede ser la batalla más importante de la Guerra. En la batalla de Palonegro se encontraron ambos bandos con miles de tropas respaldandolos. La batalla era 21.000 personas; la derrota fue de los Liberales, haciendo a que cambiaran de táctica.
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El Partido Nacional intenta con varios importantes Conservadores y Liberales negociar alguna paz debido a los ultimos ataques ocurridos; pero resulta inutil ya que ninguno de los dos bandos busca dialogar con el gobierno. Esto provoca a que los dos bandos aliarse en contra el gobierno y asi hacer un Golpe de Estado –todo esto fue en la ciudad de Bogotá.
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Esta empezó debido a que ese tiempo, los Liberales vencidos en casi su totalidad; siendo asi algo perfecto una última batalla para derrocarlos. Causando una batalla en Venezuela debido a la involucración de este país en el lado Liberal. En la batalla, los Liberales eran la minoria, pero debido a sus posiciones, lograron defender exitosamente y asi restaurando el prestigio del presidente venezolano –Cipriano Castro.
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Ya en este tiempo, la mayor parte de la fuerza Liberal fue derrotada pero esta aun persisitia. Habian tropas para retomar Panamá en David y Aguadulce, necesitaban el espiritu Liberal de vuelta. El gobierno se dio cuenta de estó e intento pararlo con refuerzos al istmo. El gobierno de EE.UU intervino tambien para ayudar al gobierno en Panamá debido a la violenta situación. Esto no tuvo exito ya que el gobierno continuo mandando refuerzos y acabando lentamente lo poco Liberal que quedaba.
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El fin de la guerra fue debido al poco apoyo en el itsmo; como ultimo recurso, tomaron el Magdalena. Pero este intento tambien fallo y los Liberales solo pudieron resignarse y aceptar su derrota. Posteriormente, se firmaron los tratados de Neerlandia y Winsconsin; siendo el primero declarando el fin y el segundo ya el definitivo con los representantes de cada bando –Liberal y Conservador.