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Genero un movimiento de construcción de ciencia americana infundiendo la a sus alumnos criollos a la independencia de Nueva Granada.Promoviendo también el método científico basado en la duda metódica y promoviendo una enseñanza basada en la indagación y investigación .
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A comparación de los demás investigadores Caldas no se enfocaba en las investigaciones o trabajos de los europeos sino que el se los imaginaba o hacia suposiciones por que encontraba cosas nuevas que nadie tenia escrita en ningún libro y que tenia poco interés..
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En Colombia en la generación de jóvenes (Francisco Jose de Caldas,Joaquin Camacho,Enrique Umaña,entre otros)estaban haciendo parte de un movimiento intelectual con aspiraciones independentistas pero fue eliminada de forma sistemática por los colonizadores los españoles.
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Francisco de Paula Santander vicepresidente en aquel momento,comenzó a formar colegios y universidades publicas por que consideraba que por medio de las investigaciones hechas en américa eran símbolo de revolución que era lo que buscaba en la independencia.
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Se crearon con el fin de solucionar el problema del desarrollo científico ya que no se tenia en cuenta una investigación previa y se desconocían lo que había sucedido antes al momento de investigar.
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Se creo con el fin de hacer un gran proyecto de adquisición de conocimiento geográfico,geológico,en agricultura .entre otros.Al final la nación lo convirtió en un esfuerzo limitado a al no tener gran presupuesto el cual siempre era para el ejercito y fuerzas militares.
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Renuncia el rector Manuel Ancizar debido a que los textos a investigar tenia fines políticos(conservadores) mas no científicos,donde no daban presupuestos para estos.
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Aparecen los primero grupos de investigación enfocados en la medicina,ingenería y geografía con el fin de generar un conocimiento propio que fuera útil para la sociedad
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Se buscaba una entidad que incentivara la investigación científica y el conocimiento por lo que Alberto Ospina Taborda con el apoyo del presidente Carlos Lleras Restrepo y Gabriel Betancur Mejía ministro de educación, en ese se le llama tiempo el Fondo Colombiano de investigaciones científicas y proyectos especiales Francisco José de Caldas. Colcienciencias nació en un momento en donde los gobiernos de Latinoamérica buscaban opciones para salir de la pobreza y el subdesarrollo
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Se creó con el fin para contar con el ente rector de la política de ciencia, tecnología e innovación que genere capacidades, promueva el conocimiento científico y tecnológico, contribuya al desarrollo y crecimiento del país y se anticipe a los retos tecnológicos futuros, siempre buscando el bienestar de los colombianos y consolidar una economía más productiva y competitiva y una sociedad más equitativa.
