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El Deportivo Pereira fue fundado para unificar a los equipos locales "Vidriocol" y "Otún", bajo impulso del capitán de policía Guillermo Gaviria Londoño -
Francisco "Paco" Mateo, un entrenador y exfutbolista español. Mateo llegó a Colombia en la década de 1940, procedente de Argentina, y fue el encargado de dirigir al equipo en su debut oficial en 1949 -
Debutó en el fútbol profesional en 1949 ante Universidad Nacional, perdiendo 1-2. El primer gol del club fue anotado por el ecuatoriano Humberto Suárez
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Desde 1950, más de 100 jugadores paraguayos se integraron al plantel. Muchos se radicaron en Pereira. Entre ellos destacaron Casimiro Avalos, goleador histórico. -
El Deportivo Pereira disputaba sus partidos en el Estadio Alberto Mora Mora, escenario protagonista de goleadas memorables como el 9-0 a Huracán de Medellín (1951) y el 6-0 a Atlético Nacional (1952)