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La primera iglesia se contruyo en el año 830 siendo la fecha de fundacion oficial casi todas las ciudades resulto destruida a finales del siglo x , el sepulcro del apostol fue practicamente lo unico respetado durante el ataque arabe , consiguio para la diocesis el rango arzobispal e impulso la construccion de la catedral de Santiago .
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De 1521 a 1821 El juicio de residencia constituye una de las figuras juridicas mas importantes y ecomiables que hubo durante el virreinato de la Nueva España , sometio juicio a Hernan Cortes por presiones de la audiencia el motivo (la muerte de su esposa) despues emprendiendo conquista de la Nueva Galicia
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Cayo en manos de los españoles, la ocopulenta ciudad que los conquistadores habian comparado con Sevilla, Roma y Constantinopla. En 1519 el emperador Moctezuma recibio a Cortes con grandes honores este pierde la vida, haci como Cuitlahuac que asume el poder pero muere a causa de biruela y Cuauhtemoc que fue capturado lo que dio a entender la caida de Tenochitlan.
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En diciembre de 1529 Nuño de Beltran de Guzman el presidente y gobernador, partio de la ciudad de Mexico y pasando por Tzintzuntzan, "el muy magnifico señor" titulo por el cual le denominaban. Al frente con tresientos españoles , de siete a ocho mil indios y con doce piezas de artilleria.
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Hubo dos expediciones la primera 1529 tenia fin de confirmar los rumores de la existencia de un territorio mas al norte y de ser asi fundar poblados. La segunda expedicion 1531 por altos indeces de mortandad y huida entre los indigenas , capturo centenas de tlaxcaltecas , la violencia utilizada por Guzman llevo a los pueblos en contra de los Españoles
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Fue la rebelion mas grande que enfrentaron los conquistadores durante la epoca colonial, apenas unos años despues de la caida de Tenochitlan , el ejercito del virrey Antonio de Mendoza aplasto el alzamiento de los pueblos chichimecas en lo que hoy es el occidente de Mexico , e hizo escramentar a los rebeldes .
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Hacia 1521 Cortez pidio una expedecion a Guzman y la conquista del occidente de nueva españa por 500 soldados y 15,00 mexicas eran utilizados como guias y trabajadores . Guzman derroto a los caciques de la region y como no existia indigenas poderosos decidio ponerle a las tierras conquistadas Guadalajara.
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En 1540 le dieron dos sitios de un ganado mayor en toluquilla y otros dos en jocotepec, por 1567 logro otras mercedes 1594 obtuvo un sitio de ganado menor; en 1609 le compro a Francisco Montero un sitio de ganado mayor en Amatitlan fue que poco a poco se conformara la provincia , las provincias subordinadas partian entre España y la Nueva Galicia.
